在Y叔的微信公众号看到了一个使用TOR访问sci-hub的教程，着实佩服，也测试一下：

1.下载洋葱并配置

最关键的点在于洋葱浏览器的安装了，由于被隔离在GFW内，所以先用蓝灯连接，下载了这个软件，然后是使用了。

测试了一下，首先选择运营商屏蔽，然后使用amazon开头的那个协议，选择不使用本地代理，等了几分钟，竟然成功了，虽然网速感人。这个过程中测试了推荐的协议，进度条走到几分之一就失败，然后第一、二个，直接没有动静，终于都不抱希望使用第三个的时候成功了。后来发现配置完成后不需要代理也能打开，不知道不开代理能不能配置，改天测试一下。 继续阅读“我也用下TOR –sci-hub洋葱浏览器测试”

在Y叔的微信公众号看到了一个好久就想用的功能包，可以用来看文章发表趋势的，一直心痒，尝试了n次以后，终于安装成功了。这过程中有几个重要的点，需要记录下来：

1.github包的安装

在百度上找的代码已经过时了，虽然仅仅是符号的差别，但是还是挺不方便的，把我找到的代码放在这。

install.packages("devtools")
 library(devtools)
 install_github("GuangchuangYu/yyplot")

继续阅读“R语言包安装笔记 Y叔包yyplotr的艰辛安装”

处理用于QPCR引物设计的16S序列

最近在做肠道微生物的课题，搜索得知SILVA数据库是最近更新而且用的最多的，看网上的教程把其全库的序列下载了下来，没有比对的有200多兆，比对完的超过三个G，参考的那个微信公众号文章说只需要下载没有比对的，我还不信邪，把两个都下载下来了，一个解压后有3G，另一个有76g多，实在是难以处理，3g多的还勉强可以操作，于是就一小的文件做了筛选。

筛选用的是我刚入门的python，虽然水平挺菜，但是至少能用，水平也或许制约这我难以处理76g的文件。贴上我的一段筛选代码，及其简单，都没有什么复杂结构，水平啊！就是从中筛选出一个门或者属/种的16S序列。 继续阅读“SILVA数据库全库下载序列的处理”

bioconda是conda上一个分发生物信息软件的频道，现在已经有超过2700款软件。由于国内没有基镜像，下载安装生物信息软件速度十分缓慢，经常中断，生物信息人迫切需要一个国内镜像。Bioconda is a channel for the conda package manager specializing in bioinformatics software。

继续阅读“bioconda中国镜像(2017.10.28更新中科大源地址)”

GATK中文社区

gatk-chinese github

生信技能树

有幸参加gatk中文文档的翻译工作，感觉还是好自豪的，虽然我还不是生信从业者，可以以这样的方式为这个行业做点事情，这就是动力！感谢jimmy和生信技能树！这是第一篇： 继续阅读“GATK软件配套资源中心有什么，如何获取？”